本書為對經濟部水利署第二河川局轄區內鳳山溪流域進行全面性環境生態及河川情勢之調查，以瞭解河川環境及生物相特性，並針對鳳山溪中下游地區進行評估工作，並藉此使鳳山溪水系河川情勢調查分析及成果更加完善。

目錄 I 表目錄 III 圖目錄 VIII 照片目錄 XI 摘要 摘-1 ABSTRACT A-1 結論與建議 結-1 第壹章 前 言 1-1 一、緣由 1-1 二、工作範圍與目標 1-1 三、工作項目及內容 1-1 四、文獻分析 1-6 第貳章 流域概要 2-1 一、地理位置 2-1 二、河系概要 2-1 三、氣象及水文 2-7 四、人文及社會經濟狀況 2-10 五、水質 2-16 六、歷年河道沖淤變化分析 2-23 七、歷年水土災害情形 2-24 八、相關管理治理情形 2-26 第參章 河川環境調查 3-1 一、河川型態 3-1 二、河川棲地調查與分析 3-8 三、河川構造物調查 3-17 四、河川空間利用分布狀況調查 3-23 第肆章 生物調查 4-1 一、調查計畫 4-1 二、水域生物調查 4-21 三、陸域動物調查 4-42 四、生態保育課題探討 4-75 第伍章 生態資源資料庫 5-1 一、資料庫架構規劃 5-1 二、資料庫建立與上傳 5-2 三、資料庫使用與查詢 5-5 第陸章 河川環境管理建議 6-1 一、歷次河川情勢調查成果比較 6-1 二、案例調查與評估 6-11 三、近期河川環境管理與河川治理應注意事項 6-62 四、生態保育措施規劃設計應注意事項 6-71 附件一 歷次審查會委員意見及辦理情形回覆對照表 附件二 快速棲地生態評估方法 附件三 河溪環境快速評估系統評估方法 附錄一 參考文獻 附錄二 生物調查成果統計分析表格(依河川情勢調查作業要點(草案)第三十一點辦理) 附錄三 河川基礎環境資料圖(依河川情勢調查作業要點(草案)第三十二點辦理)