民國105年(2016) 2月6日美濃大地震，致使北棟教室、大禮堂、辦公廳等古蹟建築本體遭受到結構上損害，為維護文化資產，高雄市政府文化局積極辦理舊鼓山國小緊急支撐及加固工程，民國105年度申辦相關經費進行古蹟修復工程計畫，民國106年起，經修復規劃設計、修復工程施作、工作紀錄報告書等保存程序，將古蹟建築結構補強後，審慎考究修繕細部亦還以原貌，期間還發現禮堂講台後設「奉安所」、北棟教室黑板下方留有日治時期的黑板等實證；同時整頓校區內庭園、植栽與附屬設施，於民國107年（2018）12月正式完工，希冀舊鼓山國小校舍與校園空間綠地特色再現，銜續地方教育功能與歷史意義，透過修復後的古蹟再展旗山人文生活與知性交流之場域。