本研究回顧國內外公共建設計畫推動相關之遴選機制，並釐清國內軌道建設計畫現況推動流程後，建議未來我國軌道建設計畫在進入綜合規劃之前須進行兩階段審查，第一階段於計畫構想提出時進行審查，除了根據各類型計畫檢視其是否符合門檻要求外，還須考量政策性、重要性、配合性、急迫性、合理性及土開效益進行計畫遴選排序，若計畫通過審查則可能獲得先期作業經費補助進行後續的可行性研究作業；第二階段審查則於可行性研究核定後進行，遴選準則除了包括構想審查時的六項準則外，尚包括經濟可行性、技術難度、環境衝擊程度與其他財務效益，相關審查結果可作為是否繼續推動後續綜合規劃之依據。本研究建議未來交通部幕僚作業單位每年應配合行政院先期作業計畫審查流程，分兩次提出建議供交通部決策參考。第一次於每年3月時提供初步建議供交通部編列預算參考；第二次於行政院與立法院通過來年總預算後進行遴選排序供交通部最終決策參考。