政府為顧及農村生活、生產環境及兼顧生物多樣性，亦配合推行生活、生產及生態之「三生目標」已二十餘年，惟已辦峻之農地重劃區並未建立相關監測或效益追蹤調查制度，導致量化資料不足。因此為補足農地重劃區之效益及生物多樣性調查，於99年度行政院農業委員會編列預算，委由本處辦理「農地重劃區環境資源調查及相關效益分析」研究案，礙於經費及研究時程，先以17處農業生產區為研究樣區，進行環境資源及生態調查分析，並蒐集日本及德國農地重劃之相關法規、經營作業與效益評估，經研究比較發現國內早期農水路設施已逐漸損壞、提供生物棲息之溝渠及河岸空間等資源紛遭佔耕，與先進國家的重視及保護顯有不足；希藉本案回顧台灣農業環境面臨之問題及供未來發展方向之參考。