兩岸直航為近年來兩岸關係之重要突破，為掌握兩岸通航契機，提升我國港埠在全球及亞太地區之競爭力，因應兩岸最新發展情勢，本研究就港口、產業發展及航運業者之可能變化及影響進行探討，並研擬我國主要港口之發展策略及定位。經分析，直航後兩岸產業分工結構之變化不大；兩岸進口櫃有大幅成長，出口櫃則持平，轉口櫃部份亦有增量，但外籍航商因受限兩岸法令，受惠有限；隨著兩岸間航運便利性的增加及港口作業能量餘裕的擴大，兩岸港口於轉口櫃之競爭可能趨於激烈。我國港口應充份利用直航之契機，首先須穩固「既有進出口及運輸型轉口作業」之櫃量；其次積極促成「物流型轉運作業」之生根；再則創造深層加工「加值型轉運作業」增量之機會。
　　由固量、創量及增量分層次第發展，以提昇港口之運量及產品之附加價值。我國港口在地理區位及服務水準上尚具有競爭優勢，直航後，宜利用兩岸航運便捷性，積極推動自由貿易港區之物流作業，建議由未來之港務公司成立單一專責單位對外招商，放寬關務作業限制及興建集中式物流園區，帶動產業的發展，使我國港口成為對大陸之物流作業基地。本計畫對大陸直航港口經營現況建置完整資料，可作為各港務局及相關政府部門未來港口業務推動之參考。