始於2019年底的COVID-19全球大流行，持續三年多，期間全民投入防疫，「嚴重特殊傳染性肺炎中央流行疫情指揮中心」成立長達1,197天。本書記錄國內外疫情變化，依疫情發展狀況將我國防疫歷程分為三個階段，詳實說明指揮中心當時在各階段的防治作為，以及指揮中心十大任務編組之工作紀錄，忠實呈現政府防疫團隊在疫情期間的各項策略考量與資源投入。本工作紀實可作為未來各界回顧這段抗疫經歷之參考，或運用作為公共衛生政策之研究與探討。

壹、前言 001
一、全球傳染病大流行應變架構 002
二、我國防疫體系 005
( 一) SARS 後的改革 005
( 二) 醫療體系應變整備 006
三、COVID-19 大流行歷程 008
( 一) 全球疫情演變 008
( 二) 國內疫情發展 011
( 三) 我國防疫三階段概述 013
( 四) 國內重要群聚事件 014
貳、三階段防疫策略 021
一、第一階段 （2019.12~2021.04） 022
( 一) 迅速啟動應變 022
( 二) 邊境即時圍堵 027
( 三) 病例發現與確認 032
( 四) 風險族群管理與社區防疫 036
( 五) 防疫物資撥配 038
( 六) 醫療體系整備 042
( 七) 防疫新生活運動 044
( 八) 秋冬防疫專案 047
二、第二階段 （2021.05~2022.03） 051
( 一) 加嚴社區防疫 051
( 二) 邊境風險嚴管 056
( 三) 調整收治策略與擴充醫療量能 058
( 四) 大規模疫苗接種 062
三、第三階段 （2022.04~2023.05） 065
( 一) 民眾自主防疫 065
( 二) 確診病人收治 067
( 三) 廣佈快篩及常規篩檢 069
( 四) 儲備及佈署藥物 072
( 五) 逐步開放邊境 074
參、指揮中心十大分組紀實 079
一、疫情監測組 081
( 一) 傳染病個案通報 081
( 二) 國際疫情監測 082
( 三) 疫情分析預測 083
( 四) 加強監測方案 085
( 五) 疫情調查 087
( 六) 國際旅遊警示 089
( 七) 國際合作 091
( 八) 疫情監測組大事記 096
二、邊境檢疫組 098
( 一) 入境檢疫 098
( 二) 滯外國人、境外生及移工協助 102
( 三) 機場及港口防疫應變 104
( 四) 機組員作業因應及航空器防疫 111
( 五) 船舶及特定產業防疫 115
( 六) 邊境檢疫組大事記 120
三、社區防疫組 122
( 一) 居家檢疫與隔離 122
( 二) 衛生行為促進 125
( 三) 各類公共場所防疫 127
( 四) 社區防疫支援措施 132
( 五) 疫苗供應與調度 138
( 六) 推動疫苗接種 144
( 七) 確認疫苗安全與納入受害救濟 149
( 八) 社區防疫組大事記 152
四、醫療應變組 156
( 一) 擴增檢驗量能及檢驗策略變遷 156
( 二) 感染管制與生物安全 159
( 三) 醫療資源盤點及啟動 160
( 四) 醫療照護服務提供 162
( 五) 藥物管理及儲備 166
( 六) 集中檢疫場所設置 168
( 七) 人口密集機構感染管制 170
( 八) 醫療照護工作人員的支持措施 171
( 九) 醫療應變組大事記 173
五、物資組 175
( 一) 防疫物資儲備與調度 175
( 二) 口罩供需調配與管理 177
( 三) 擴大供應家用快篩試劑 179
( 四) 其他防疫物資供應管理 181
( 五) 護臺灣 助世界 182
( 六) 物資組大事記 183
六、研發組 187
( 一) 疫苗研發 187
( 二) 藥物研發 193
( 三) 檢驗診斷及快篩試劑研發 194
( 四) 技術支援平台設置 196
( 五) 流行病學預測與決策建議 197
( 六) 研發組大事記 200
七、資訊組 201
( 一) 防疫風險溝通 203
( 二) 邊境管制至隔離檢疫流程資訊化 204
( 三) 口罩與疫苗分配資訊化 209
( 四) 輔助疫調與社交距離應用 211
( 五) 數位證明 213
( 六) 資料交換與資安管理 214
( 七) 資訊組大事記 216
八、行政組 218
( 一) 指揮中心運作 218
( 二) 防疫人力動員招募 221
( 三) 編列特別預算 225
( 四) 各方意見調和與回應 227
( 五) 行政組大事記 231
九、新聞宣導組 233
( 一) 風險溝通 233
( 二) 多元管道運用策略 234
( 三)1922 防疫專線 238
( 四) 輿情監測與回應 240
( 五) 新聞宣導組大事記 242
十、法制組 244
( 一) 特別條例制定 244
( 二) 防疫應變之法制作業 247
( 三) 特別條例第7 條之運用 249
( 四) 假訊息查處 250
( 五) 個人資料保護 251
( 六) 法制組大事記 254
肆、後記 255
( 一) 國際間的應變檢討 256
( 二) 國內的疫後復原 257
( 三) 防疫成效國際比較 258
伍、COVID-19 大事記 265
2019 年 266
2020 年 266
2021 年 272
2022 年 277
2023 年 281