本書是日本著名佛教哲學家井上圓了在哲學館教授的講義。作者從民俗學角度研究妖怪，於19世紀末開創「妖怪學」。指出反對迷信、建立健全的道德不可無健全的知識，「不去其迷心，則道德革新之功，實無可期」，必須祛人心之迷妄，普及科學知識。蔡元培試圖透過譯述《妖怪學講義錄（總論迷信與文化四書）》以振興教育啟蒙和推進社會道德。
《妖怪學講義》最初刊載於黃摩西主辦的《雁來紅叢報》。全書共分總論、理學、醫學、純正哲學、心理學、宗教學、教育學與雜部八門。由亞泉學館購印，後因該學館失火，本書譯稿原有六冊，其中五冊均付之一炬，僅餘《總論》一冊，由商務印書館於光緒三十二年(西元1906年)八月印行。本書是僅餘的《總論》。

作者簡介：
井上圓了（1858-1919）
日本明治中後期佛教哲學家，教育家，近代妖怪研究的創始者。
1885年，畢業於東京帝國大學哲學科。1887年，創建哲學館（東洋大學前身）。三次留學歐美，晚年建立哲學堂。

原序一(初版)
原序二(再版)
緒言
卷之一上
第一講 定義篇
第一節 開講
第二節 妖怪與不思議之異同
第三節 妖怪與異常變態之關係
第四節 妖怪之標準
第五節 假怪與真怪之別
第六節 迷誤之原因

第二講 學科篇
第七節 妖怪學之所以未設學科 第八節 學問全體之學科表
第九節 妖怪學所以為應用學 第十節 心性與妖怪之關係
第十一節 妖怪學與心理學之關係
第十二節 妖怪學與諸學之關係
第十三節 第二分類法
第十四節 第二分類表
第十五節 第三分類法
第十六節 學科分類之歸結

第三講 關係篇
第十七節 實際上之關係
第十八節 與宗教之關係
第十九節 與教育之關係
第二十節 與政治之關係
第二十一節 與醫術之關係
第二十二節 與實業之關係
第二十三節 與風俗之關係

第四講 種類篇
第二十四節 妖怪之分類
第二十五節 物理的妖怪之種類
第二十六節 心理的妖怪之種類
第二十七節 心理學上之分類
第二十八節 諸學上之妖怪
第二十九節 理學的及哲學的妖怪
第三十節 真正之妖怪

第五講 歷史篇
第三十一節 妖怪學之歷史
第三十二節 太古之時代
第三十三節 發達之時期
第三十四節 第一時期
第三十五節 第二時期
第三十六節 第三時期
第三十七節 理外的說明法
第三十八節 惟心的說明法
第三十九節 經驗的說明法
第四十節 說明法之歸結
第四十一節 妖怪事項之起原及發達
第四十二節 妖怪歷史之分類

第六講 原因篇
第四十三節 迷誤之原因
第四十四節 妖怪談話之真偽
第四十五節 知識與妖怪之關係
第四十六節 妖怪與論理之關係
第四十七節 演繹的妖怪
第四十八節 歸納的妖怪
第四十九節 因果與妖怪之關係
第五十節 事實考定法 第五十一節 妖怪體之大分類

卷之一中
第七講 說明篇第一
第五十二節 心理學上之說明
第五十三節 物心相關之說明
第五十四節 身心相關之說明
第五十五節 神經系統
第五十六節 感覺及知覺
第五十七節 再想及構想
第五十八節 虛想
第五十九節 感情及意志

第八講 說明篇第二
第六十節 意識論第一（定義）
第六十一節 意識論第二（意識、無意識之別）
第六十二節 意識論第三（心力與意識之關係）
第六十三節 意識論第四（意識之範圍）
第六十四節 意識論第五（意識與觀念之關係）
第六十五節 意識論第六（意識與社會之比較）
第六十六節 注意論第一（注意之義解及性質）
第六十七節 注意論第二（注意與意識之關係）

第九講 說明篇第三
第六十八節 習慣論第一
第六十九節 習慣論第二
第七十節 聯想論第一
第七十一節 聯想論第二
第七十二節 信仰論第一
第七十三節 信仰論第二
第七十四節 驚情論第一
第七十五節 驚情論第二
第七十六節 恐怖論第一
第七十七節 恐怖論第二
第七十八節 複情論第一
第七十九節 複情論第二
第八十節 複情論第三
第八十一節 想像論第一
第八十二節 想像論第二
第八十三節 願望論第一
第八十四節 願望論第二
第八十五節 意志論第一
第八十六節 意志論第二
第八十七節 意志論第三
第八十八節 情意論歸結

卷之一下
第十講 說明篇第四 變式的心理學第一 總論
第八十九節 妖怪的現象
第九十節 變態之起原
第九十一節 妖怪之要素
第九十二節 外界之要素
第九十三節 中間之要素第一
第九十四節 中間之要素第二
第九十五節 內界之要素第一
第九十六節 內界之要素第二
第九十七節 情意之異狀
第九十八節 妖怪要素之全表

第十一講 說明篇第五 變式的心理學 各論
第九十九節 感覺論順序
第百節 視覺之異象第一
第百一節 視覺之異象第二
第百二節 聽覺之異象第一
第百三節 聽覺之異象第二
第百四節 觸覺之異象第一
第百五節 觸覺之異象第二
第百六節 嗅覺之異象
第百七節 味覺之異象
第百八節 有機感覺之異象
第百九節 知覺之異象

第十二講 說明篇第六 變式的心理學 各論第二
第百十節 內想之異狀總論
第百十一節 再想之異狀
第百十二節 構想之異狀
第百十三節 虛想之異狀第一
第百十四節 虛想之異狀第二
第百十五節 虛想之異狀第三
第百十六節 感情之異狀
第百十七節 意志之異狀
第百十八節 說明篇 結論
第百十九節 真怪論
第百二十節 結論